Jul 02, 2023
Los datos recientes aumentan el caso de utilidad clínica para la prueba de cáncer de próstata de diagnóstico de exosomas
NUEVA YORK – Datos publicados el mes pasado en Prostate Cancer and Prostatic Diseases
NUEVA YORK – Los datos publicados el mes pasado en Prostate Cancer and Prostatic Diseases están construyendo aún más el caso de utilidad clínica para la prueba de próstata ExoDx de Exosome Diagnostics, subsidiaria de Bio-Techne, dijo la compañía.
El estudio se realizó como seguimiento de un ensayo de utilidad clínica realizado por la empresa cuyos resultados se publicaron en 2020, también en Prostate Cancer and Prostatic Diseases. En el estudio original, realizado por Exosome Diagnostics y CareFirst BlueCross/BlueShield de Maryland, se recopilaron datos de 1049 hombres de 50 años o más que tenían niveles de antígeno prostático específico ligeramente elevados. Aunque todos los pacientes en el estudio recibieron la prueba de próstata ExoDx, los pacientes en el grupo de control ciego no obtuvieron sus resultados y continuaron con el tratamiento de atención estándar.
La prueba molecular mide una firma de expresión de tres genes en la orina y utiliza un algoritmo para proporcionar una puntuación de riesgo que discrimina entre el cáncer de próstata benigno o de bajo grado y el cáncer de próstata de alto grado.
Ese estudio original encontró que el grupo que recibió los resultados de la prueba se sometió a un 23 por ciento más de biopsias que el grupo de control, pero que las biopsias se aplicaron de manera más adecuada y se encontraron aproximadamente un 30 por ciento más de cánceres de próstata de alto grado.
En el nuevo estudio, se realizó un análisis de resultados retrospectivo dos años y medio después del estudio original en 833 pacientes para ver cómo la prueba afectó su atención y los resultados, dijo Johan Skog, CSO de la firma y autor principal de ambos artículos. . Los investigadores evaluaron los resultados de la patología clínica en ambas cohortes del estudio y compararon los aplazamientos de la biopsia y el tiempo de la biopsia entre los brazos del estudio para los casos con puntajes de riesgo bajo o alto.
Los autores encontraron que los pacientes que fueron identificados como de bajo riesgo por la prueba ExoDx recibieron menos biopsias, retrasaron el momento de su primera biopsia y tenían significativamente menos probabilidades de ser diagnosticados posteriormente con cáncer de próstata de alto grado. El tiempo promedio desde la prueba hasta la primera biopsia fue significativamente más largo en la cohorte de bajo riesgo que recibió sus resultados en comparación con los pacientes de alto riesgo en ese mismo grupo y los pacientes de bajo riesgo en el grupo cegado. Los pacientes de bajo riesgo del segundo grupo no pudieron identificarse mediante los métodos estándar de atención y recibieron una biopsia a pesar de su menor riesgo.
Además, los pacientes de bajo riesgo que conocían los resultados de sus pruebas tenían menos probabilidades de someterse a biopsias que los pacientes de alto riesgo en el mismo grupo, mientras que la elección de someterse a una biopsia no difirió entre los pacientes de alto y bajo riesgo en el control. brazo, anotaron los investigadores en el artículo. Skog dijo que esto demostró que "no hay forma de que el médico identifique a los pacientes de bajo y alto riesgo con otros medios", y agregó que la prueba "brinda información realmente única que el médico no puede deducir de otros estándares de factores de cuidado”.
Según Skog, estos nuevos datos fortalecen aún más la utilidad de la prueba y muestran que los médicos que no proporcionen la prueba no obtendrán los resultados favorables observados en este estudio. Los médicos "siempre quieren ver que la atención de sus pacientes mejora con la utilización de la prueba, y eso es lo que muestra este estudio", dijo.
Estos resultados son una medida provisional de un período de seguimiento de cinco años, y se analizarán y publicarán más resultados en otros dos años y medio, anotó.
La compañía también está realizando otros estudios sobre la prueba, analizando otros usos indicados y evaluando cómo podría integrarse con imágenes de resonancia magnética u otros biomarcadores, dijo Skog. Si bien este estudio se centró en la población de detección inicial de pacientes con PSA ligeramente elevado, la empresa también está realizando estudios en la población de vigilancia activa.
plataforma multiómica
Más allá de la prueba de cáncer de próstata, Exosome Diagnostics ha construido y está utilizando una plataforma multiómica para integrar aún más sus biomarcadores de biopsia líquida, dijo Skog.
Está coaislando ADN libre de células y ARN exosomal en una plataforma basada en secuenciación de próxima generación para "construir una trampa para ratones mucho mejor" y obtener acceso a más información molecular, desarrollando así mejores pruebas, dijo, aunque se negó a hacerlo. nombrar el instrumento NGS en el que Exosome Dx está desarrollando su propia tecnología. Con la plataforma, aún sin nombre, la compañía puede realizar análisis de metilación y mutación en cfDNA, junto con detección de mutaciones a través de análisis de expresión diferencial de transcriptoma de ARN con secuenciación en el ARN exosomal. Brinda "una visión única de los diferentes tipos de enfermedades", dijo, y la plataforma se puede aplicar "de una manera independiente de la enfermedad".
El kit ExoLution Plus de la empresa es su método inicial de aislamiento de muestras y se ha utilizado anteriormente para mejorar la detección de mutaciones, dijo Skog, y señaló que el kit habilita toda la plataforma multiómica.
En un artículo publicado en Annals of Oncology en 2017, la compañía y sus colaboradores de investigación descubrieron que aislar tanto el ARN exosomal como el cfDNA podrían mejorar la detección de mutaciones de EGFR en pacientes con cáncer de pulmón de células no pequeñas. El uso de cfDNA y ARN exosómico resultó en una sensibilidad del 98 % para detectar mutaciones activadoras de EGFR y del 90 % para mutaciones de EGFR T790M, mientras que el uso de ADN tumoral circulante por sí solo tuvo una sensibilidad del 82 % para activar mutaciones y del 84 % para T790M.
Actualmente, la plataforma se está utilizando para el desarrollo de diagnóstico interno y se ofrece a socios farmacéuticos, aunque todavía no hay datos publicados al respecto, dijo Skog. La plataforma proporciona una "ventanilla única" para obtener el máximo beneficio de una muestra, extrayendo tanto cfDNA como ARN exosomal en un solo paso y permitiendo a la empresa "obtener mejores respuestas de nuestros biomarcadores".
En este momento, la empresa tiene programas de diagnóstico centrados en el cáncer colorrectal y otras indicaciones oncológicas, y está viendo los beneficios del uso de la plataforma para observar tanto el cfDNA como el ARN exosomal, en lugar de los métodos tradicionales de biopsia líquida que solo buscan el cfDNA, dijo Skog. La plataforma puede preservar la integridad de lo que captura, lo que permite el análisis de ARN pequeño, así como la creación de perfiles globales de ARN mensajeros y ARN largos no codificantes. La plataforma también ha facilitado el análisis de mapeo de vías para comprender qué vías asociadas a enfermedades se están desregulando en diferentes condiciones, agregó.
Otras compañías de diagnóstico también están utilizando biopsia líquida para analizar tanto cfDNA como RNA. La empresa de diagnóstico del cáncer Circulogene ofrece pruebas que utilizan secuenciación de próxima generación y PCR para analizar el ADN y el ARN, mientras que Caris Life Sciences ha estado desarrollando una versión basada en sangre de su servicio integral de perfilado genómico que secuencia ADNcf y ARNcf.
Bio-Techne también tiene programas fuera de la oncología donde se utiliza la plataforma, como enfermedades neurodegenerativas, monitoreo de trasplantes, enfermedades inflamatorias y trastornos autoinmunes. Si bien la tecnología de Exosome Dx puede extraer tanto cfDNA como RNA exosomal, Skog señaló que la compañía solo extrae cfDNA "cuando agrega valor", como en ciertas aplicaciones de oncología donde la detección temprana de marcadores de metilación es útil. Muchas aplicaciones, incluidas la prueba de próstata ExoDx y la prueba de rechazo de trasplante de riñón ExoTru, no incluyen la captura de cfDNA.
La capacidad de extraer "material de alta calidad" ha hecho posible que la empresa realice análisis únicos y utilice tipos de muestras menos comunes, como líquido cefalorraquídeo y saliva. A menudo ha sido un desafío trabajar con saliva debido a la contaminación microbiana, pero la compañía ha podido usar su plataforma multiómica para realizar un perfil completo del transcriptoma de ARN en una muestra de saliva, dijo.
Por ejemplo, la firma está utilizando su tecnología para mapear y monitorear vías autoinmunes que se expresan de manera diferencial y están desreguladas en la saliva de pacientes con la enfermedad de Sjogren, un trastorno autoinmune que afecta las glándulas de secreción de fluidos. La compañía tiene un estudio en curso para perfilar el ARN en muestras de saliva de pacientes con enfermedad de Sjogren, anotó.
La plataforma proporciona una "caja de herramientas... mucho más amplia para observar múltiples tipos diferentes de enfermedades" y ayuda a "resolver preguntas complejas sobre biomarcadores", dijo.
plataforma multiómica